uso de recursos informáticos en biología y genética molecular objetivos de aprendizaje. que los asistentes al curso se inicien en el uso
Uso de recursos informáticos en Biología y Genética Molecular
Objetivos de aprendizaje.
Que los asistentes al curso se inicien en el uso de algunos programas
bioinformáticos y bases de datos disponibles en la “World Wide Web” de
aplicación rutinaria en Biología y Genética molecular. Estas
herramientas informáticas permiten la búsqueda y obtención de
información acerca de genes relacionados con enfermedades hereditarias
humanas.
Metodología.
Tras una breve introducción de conceptos básicos de Biología
Computacional y Bioinformática, los asistentes al curso llevan a cabo
todas las actividades utilizando un ordenador personal conectado a
Internet. Los alumnos cuentan con un guión detallado de las
actividades, las tareas específicas a realizar, y una lista de los
sitios web que utilizarán. En paralelo con los alumnos el profesor
lleva a cabo las actividades propuestas, y guía a los asistentes
mediante proyección en pantalla de su ventana informática de trabajo.
Programa de actividades:
En este curso se usará como ejemplo el gen Frataxina, cuya mutación
provoca la enfermedad de la ataxia de Friedreich.
1) Búsqueda de información en la literatura científica usando PubMed
Artículos de investigación
Libros especializados y manuales
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Literature/
2) Búsqueda de información en OMIM, una base de datos de enfermedades
hereditarias humanas y sus genes asociados.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Literature/
3) Exploración de la estructura genómica de Frataxina en el genomio
humano con ENSEMBL.
http://www.ensembl.org/index.html
4) Recopilar datos acerca de la función y otras propiedades de la
proteína Frataxina mediante su clasificación GO (Ontología Génica) con
el programa AmiGO.
http://www.geneontology.org
5) Búsqueda de las propiedades de la proteína Frataxina derivadas de
su estructura primaria y secundaria en Swiss-Prot.
http://www.expasy.org/
6) Exploración de la estructura terciaria y cuaternaria de la proteína
Frataxina en PDB y PDBsum.
http://www.ebi.ac.uk/pdbsum/